当前位置:首页 > 招标公告>生物信息学服务平台(ZBZXJJ20250111)采购公告

招标公告 四川省

公告内容

项目名称 生物信息学服务平台 项目编号 ZBZXJJ2注册后查看1
公告开始日期 2****5-0**$3-2**$3 0**$3:0**$3:3**$3 公告截止日期 2****5-0**$3-2**$3 1**$3:0**$3:0**$3
采购单位 四川大学 付款方式 进口设备: 甲方与所委托的进口代理公司】企业联系人及联系方式" class="noselttqk" names="甲方与所委托的进口代理公司" dname="2670b69964fa7eeed9f7509e0ec3f0ae">】企业联系人及联系方式" src="/images/tel88.png" />签订代理进口委托协议后,将进口项目货款支付给代理公司指定的银行账户,项目货款仅用于本进口项目的信用证或TT付汇及进口相关费用等。进口代理公司收到甲方合同货款后,按外贸合同要求及时履行与乙方委托的境外代理公司的付款义务。 国产设备:甲方应在完成验收并建立固定资产后向乙方一次性支付本合同的总款项,乙方须向甲方出具合法有效完整的完税发票及凭证资料进行支付结算。
联系人 成交后在我参与的项目中查看 联系电话 成交后在我参与的项目中查看
签约时间要求 到货时间要求 合同签订后7个日历日内
预算总价 ¥ 4注册后查看0.0**$3 + NaN + NaN
发票要求 增值税普通发票 增值税专用发票
含税要求
送货要求
安装要求
收货地址 一环路南一段2**$3号四川大学望江校区
供应商资质要求

符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

公告说明
采购清单1
采购商品 采购数量 计量单位 所属分类
生物信息学服务平台 1 服务器
品牌 品牌1 戴尔
型号 R7***0
品牌2
型号
品牌3
型号
品牌4
型号
品牌5
型号
品牌6
型号
预算单价 ?4注册后查看0.0**$3
技术参数及配置要求 1.硬件要求:
1.1 处理器:支持两个第 3 代英特尔至强可扩展处理器(每个处理器多达 4**$3 个核心)
1.2 内存:3**$3 个 DDR4 DIMM 插槽,支持最高2TB RDIMM或4TB LRDIMM,速率高达 3****0 MT/s;可同时安装1**$3条英特尔傲腾持久内存2***0系列,最大可达8TB
1.3 存储控制器:内部控制器:PERC H7***5; 引导优化型存储子系统 (BOSS-S2):HW RAID 2 x M.2 SSD 2***0 GB;外部 PERC (RAID):PERC H8***0
1.4 驱动器托架:正面托盘:1**$3 x 3.5 英寸 SAS/SATA (HDD/SSD),最大可达 1***2 TB
1.5 电源装置 : 1****0 W 白金 AC/2***0 HVDC
1.6 风扇:风扇/高性能 SLVR 风扇/高性能金牌级风扇
1.7 外形规格:2U 机架式
1.8 安全性:加密签名固件;安全引导;安全擦除;硅片信任根;系统锁定(需要 iDRAC9 Enterprise 或 Datacenter);TPM 1.2/2.0 FIPS、CC-TCG 认证、TPM 2.0 中国 NationZ
1.9 端口:前置端口 1 个专用 iDRAC Direct micro-USB ,1 个 USB 2.0 ,1 个 VGA
*2.软件要求(必须满足项):
2.1 操作系统和虚拟机管理程序:Canonical Ubuntu Server LTS
2.2 OpenManage 软件:OpenManage Enterprise
2.3 基础环境工具:Conda/Mamba:包管理与虚拟环境;Docker/Singularity:容器化部署;Snakemake/Nextflow:流程自动化管理
2.4 数据预处理与质控:FastQC:原始数据质量评估;Trimmomatic:去接头与低质量序列;Cutadapt:引物/接头去除(支持扩增子);Fastp:快速质控(支持UMI);MultiQC:多样本质控报告整合
2.5 基因组分析:
2.5.1组装工具
SPAdes:细菌/真菌短读长组装
Unicycler:混合组装(Illumina+长读长)
Flye:长读长组装(ONT/PacBio)
Canu:长读长纠错与组装
MEGAHIT:高效宏基因组短读长组装
2.5.2组装评估与优化
QUAST:Contig统计(N5**$3/GC含量)
BUSCO:基因组完整性评估
CheckM/CheckM2:原核基因组质量检测
Pilon:短读长纠错
2.5.3注释工具
Prokka:原核快速注释(基因/rRNA/tRNA)
Bakta:高精度注释(含CRISPR/sRNA)
Funannotate:真菌专用注释
BRAKER:真核基因预测(结合RNA-Seq)
2.5.4功能与进化分析
eggNOG-mapper:COG/KEGG/GO功能注释
antiSMASH:次级代谢产物基因簇预测
CRISPRCasFinder:CRISPR识别
Roary:泛基因组分析
OrthoFinder:直系同源聚类
FastTree/IQ-TREE:进化树构建
Gubbins:重组区域检测
2.6、扩增子分析(1**$3S/ITS等)
2.6.1核心流程
QIIME 2:全流程分析(ASV/OTU、多样性)
Mothur:经典OTU聚类流程
DADA2(R包):ASV去噪
Deblur:1**$3S ASV生成
2.6.2序列处理与分类
VSEARCH:序列去冗余/嵌合体检测
RDP Classifier:贝叶斯分类注释
SINTAX:分类学注释(需USEARCH)
2.6.3数据库
SILVA:细菌/古菌1**$3S数据库
Greengenes:经典1**$3S数据库
UNITE:真菌ITS数据库
2.7、宏基因组分析
2.7.1组装与分箱
MetaSPAdes:复杂群落组装
metaHipMer:超大规模组装
MetaBAT2:丰度与序列分箱
MaxBin2:单拷贝基因分箱
VAMB:深度学习分箱
dRep:基因组去冗余
2.7.2物种与功能注释
Kraken2/Bracken:k-mer物种分类
MetaPhlAn4:标记基因物种定量
HUMAnN3:宿主-微生物通路分析
DRAM:代谢潜能注释
2.7.3抗性基因与代谢
ABRicate:抗性基因筛查(CARD/ResFinder)
DeepARG:深度学习抗性预测
2.7.4可视化与统计
Anvi'o:交互式整合分析
STAMP:差异统计分析
Krona:物种组成环形图
2.8、公共数据库资源
NCBI NT/NR:核酸/蛋白参考库
KEGG/eggNOG/UniProt:功能注释库
GTDB:基因组分型分类库
CARD/ResFinder/VFDB:抗性/毒力因子库
MGnify:宏基因组整合数据库
2.9、辅助工具
InterProScan:蛋白结构域注释
MMseqs2:快速序列搜索聚类
CoverM:基因组覆盖度计算
PhyloPhlAn:系统发育树构建
2.1**$3、可视化工具
ggplot2/ComplexHeatmap(R包):图表绘制
iTOL:进化树高级注释
Pavian:交互式结果展示
参考链接
售后服务 服务年限:6**$3月;电话支持:7x8小时;商品承诺:原厂全新未拆封正品;质保期:一年;

四川大学

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