当前位置:首页 > 招标公告>生物信息学服务平台(ZBZXJJ20250111)采购公告
招标公告
四川省
公告内容
项目名称 | 生物信息学服务平台 | 项目编号 | ZBZXJJ2注册后查看1 |
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公告开始日期 | 2****5-0**$3-2**$3 0**$3:0**$3:3**$3 | 公告截止日期 | 2****5-0**$3-2**$3 1**$3:0**$3:0**$3 |
采购单位 | 四川大学 | 付款方式 | 进口设备:
甲方与所委托的进口代理公司![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
联系人 | 成交后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 成交后在我参与的项目中查看 |
签约时间要求 | 到货时间要求 | 合同签订后7个日历日内 | |
预算总价 | ¥ 4注册后查看0.0**$3 | ||
发票要求 | |||
收货地址 | 一环路南一段2**$3号四川大学![]() |
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供应商资质要求 |
符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 |
采购清单1
采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
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生物信息学服务平台 | 1 | 台 | 服务器 |
品牌 | 戴尔 |
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型号 | R7***0 |
预算单价 | ¥?4注册后查看0.0**$3 |
技术参数及配置要求 | 1.硬件要求: 1.1 处理器:支持两个第 3 代英特尔至强可扩展处理器(每个处理器多达 4**$3 个核心) 1.2 内存:3**$3 个 DDR4 DIMM 插槽,支持最高2TB RDIMM或4TB LRDIMM,速率高达 3****0 MT/s;可同时安装1**$3条英特尔傲腾持久内存2***0系列,最大可达8TB 1.3 存储控制器:内部控制器:PERC H7***5; 引导优化型存储子系统 (BOSS-S2):HW RAID 2 x M.2 SSD 2***0 GB;外部 PERC (RAID):PERC H8***0 1.4 驱动器托架:正面托盘:1**$3 x 3.5 英寸 SAS/SATA (HDD/SSD),最大可达 1***2 TB 1.5 电源装置 : 1****0 W 白金 AC/2***0 HVDC 1.6 风扇:风扇/高性能 SLVR 风扇/高性能金牌级风扇 1.7 外形规格:2U 机架式 1.8 安全性:加密签名固件;安全引导;安全擦除;硅片信任根;系统锁定(需要 iDRAC9 Enterprise 或 Datacenter);TPM 1.2/2.0 FIPS、CC-TCG 认证、TPM 2.0 中国 NationZ 1.9 端口:前置端口 1 个专用 iDRAC Direct micro-USB ,1 个 USB 2.0 ,1 个 VGA *2.软件要求(必须满足项): 2.1 操作系统和虚拟机管理程序:Canonical Ubuntu Server LTS 2.2 OpenManage 软件:OpenManage Enterprise 2.3 基础环境工具:Conda/Mamba:包管理与虚拟环境;Docker/Singularity:容器化部署;Snakemake/Nextflow:流程自动化管理 2.4 数据预处理与质控:FastQC:原始数据质量评估;Trimmomatic:去接头与低质量序列;Cutadapt:引物/接头去除(支持扩增子);Fastp:快速质控(支持UMI);MultiQC:多样本质控报告整合 2.5 基因组分析: 2.5.1组装工具 SPAdes:细菌/真菌短读长组装 Unicycler:混合组装(Illumina+长读长) Flye:长读长组装(ONT/PacBio) Canu:长读长纠错与组装 MEGAHIT:高效宏基因组短读长组装 2.5.2组装评估与优化 QUAST:Contig统计(N5**$3/GC含量) BUSCO:基因组完整性评估 CheckM/CheckM2:原核基因组质量检测 Pilon:短读长纠错 2.5.3注释工具 Prokka:原核快速注释(基因/rRNA/tRNA) Bakta:高精度注释(含CRISPR/sRNA) Funannotate:真菌专用注释 BRAKER:真核基因预测(结合RNA-Seq) 2.5.4功能与进化分析 eggNOG-mapper:COG/KEGG/GO功能注释 antiSMASH:次级代谢产物基因簇预测 CRISPRCasFinder:CRISPR识别 Roary:泛基因组分析 OrthoFinder:直系同源聚类 FastTree/IQ-TREE:进化树构建 Gubbins:重组区域检测 2.6、扩增子分析(1**$3S/ITS等) 2.6.1核心流程 QIIME 2:全流程分析(ASV/OTU、多样性) Mothur:经典OTU聚类流程 DADA2(R包):ASV去噪 Deblur:1**$3S ASV生成 2.6.2序列处理与分类 VSEARCH:序列去冗余/嵌合体检测 RDP Classifier:贝叶斯分类注释 SINTAX:分类学注释(需USEARCH) 2.6.3数据库 SILVA:细菌/古菌1**$3S数据库 Greengenes:经典1**$3S数据库 UNITE:真菌ITS数据库 2.7、宏基因组分析 2.7.1组装与分箱 MetaSPAdes:复杂群落组装 metaHipMer:超大规模组装 MetaBAT2:丰度与序列分箱 MaxBin2:单拷贝基因分箱 VAMB:深度学习分箱 dRep:基因组去冗余 2.7.2物种与功能注释 Kraken2/Bracken:k-mer物种分类 MetaPhlAn4:标记基因物种定量 HUMAnN3:宿主-微生物通路分析 DRAM:代谢潜能注释 2.7.3抗性基因与代谢 ABRicate:抗性基因筛查(CARD/ResFinder) DeepARG:深度学习抗性预测 2.7.4可视化与统计 Anvi'o:交互式整合分析 STAMP:差异统计分析 Krona:物种组成环形图 2.8、公共数据库资源 NCBI NT/NR:核酸/蛋白参考库 KEGG/eggNOG/UniProt:功能注释库 GTDB:基因组分型分类库 CARD/ResFinder/VFDB:抗性/毒力因子库 MGnify:宏基因组整合数据库 2.9、辅助工具 InterProScan:蛋白结构域注释 MMseqs2:快速序列搜索聚类 CoverM:基因组覆盖度计算 PhyloPhlAn:系统发育树构建 2.1**$3、可视化工具 ggplot2/ComplexHeatmap(R包):图表绘制 iTOL:进化树高级注释 Pavian:交互式结果展示 |
售后服务 | 服务年限:6**$3月;电话支持:7x8小时;商品承诺:原厂全新未拆封正品;质保期:一年; |
四川大学
2****5-0**$3-2**$3 0**$3:0**$3:3**$3
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